終電後、カプセルホテルで、上司に微熱伝わる夜。

第1巻

入社1年目の新人、相澤みのりは、仕事にも同僚にも恵まれてはいるものの、唯一上司の羽田野秋彦とは衝突してばかりの日々を過ごしていた。そんなある日、会社の飲み会でみのりは気持ちが悪くなり、そのまま終電を逃してしまう。みのりを介抱するために残った羽田野は、タクシーで帰宅するのもなんだろうからと、カプセルホテルに宿泊することを提案する。男女別のフロアのため、一旦はエントランスで別れた二人だったが、部屋のトラブルでみのりは眠る場所を失ってしまう。そんなみのりを羽田野は自室へ誘い、二人は一つのカプセルに入ることになる。これまでお互いに異性として意識していなかったものの、狭い空間に薄着の男女が二人きりという特異なシチュエーションもあり、なし崩し的に身体の関係を持ってしまう。これをきっかけに、羽田野とみのりは交際していないものの、何度も身体の関係を持つようになる。そんな中、みのりと羽田野は新進気鋭のモデル、菅原慧の衣装制作を任される。激務に休むヒマもない羽田野は、ついに倒れてしまい、今度はみのりが羽田野の世話をすることになる。

第2巻

菅原慧が出演するショーの衣装制作を任された相澤みのりは、慣れない業務に戸惑いながらも奮闘する中で、みのりと慧の距離は一気に縮まり、羽田野秋彦はひそかに嫉妬心を募らせていく。一方のみのりは、なし崩し的に何度も羽田野と身体の関係を持つようになってから、羽田野のことを意識するようになっていた。そんな中、慧が出演するショーは当日を迎え、みごとに成功を収める。そして、みのりに恋心を抱いた慧は勇気を出して告白する。みのりはその気持ちを嬉しく感じつつも、自分の心の中には羽田野がいることを実感し、慧の告白を断るのだった。こうしてお互いに異性として意識していることを認めたみのりと羽田野だったが、みのりはひょんなことから羽田野の元彼女の話を聞いてしまう。みのりは元彼女が、自分と正反対の性格だと知り、自分はしょせん身体の関係だけなのかとショックを受ける。さらに、実際に元彼女の豊島菜々美と出会ったり、羽田野とのツーショット写真を見てしまったことで、みのりは次第に自信を失っていく。

第3巻

相澤みのりのもとに、再び菅原慧の衣装を担当して欲しいとの依頼が舞い込み、羽田野秋彦や新井和男と共に温泉旅館での写真撮影がスタートする。今回の撮影は奇しくも羽田野の元彼女である豊島菜々美が担当する雑誌の撮影で、彼女も同行することになる。みのりは仕事に集中しようとするものの、羽田野と菜々美の動向ばかりが気になってしまい、仕事にまったく身が入らないでいた。二人の様子をうかがっていることに気づいた慧からの助言により、みのりは羽田野に告白をすることを決意する。一方の羽田野も菜々美から復縁の申し出を受けるが、羽田野は自分の心にもうみのりしかいないことを実感していた。こうして二人は改めてお互いの気持ちを確認し合い、晴れて付き合うことになる。これから幸せな交際がスタートすると思われた矢先、羽田野に海外のデザイン会社から、スカウトの声がかかる。ずっとあこがれていた会社からのオファーに羽田野は喜びを抱きながらも、交際したばかりのみのりを残して海外に行くことに思い悩む。

第4巻

相澤みのりの後押しと、自らの長年の夢を叶えるため、羽田野秋彦は海外へと旅立つ。しかし数か月後、羽田野は突然海外から戻って来る。事情を話したがらない羽田野に対し、みのりは本人がその理由を話すまで待つことにする。帰国後、離れていた時間を取り戻すかのように、みのりと羽田野は二人だけの時間を過ごし、より絆を深めていく。そんな中、菅原慧の歌手デビューが決まる。そして初めてのコンサートを大盛況で終え、そのあとに慧はみのりに対して、最後の告白を行なう。再度みのりから断られた慧は、潔く身を引くことを決意し、羽田野の幸せを願うのだった。そんなある日、みのりの会社に羽田野の高校時代の同級生で、現在は海外有名ブランドのマネージャーを務めている成瀬尊がやって来る。有名人の登場に会社内は歓迎ムードに包まれるが、成瀬はこの会社を買収するためにやってきたと告げるのだった。

TVアニメ

2018年10月より、本作『終電後、カプセルホテルで、上司に微熱伝わる夜。』のTVアニメ版『終電後、カプセルホテルで、上司に微熱伝わる夜。』が、TOKYO MXで放送された。インターネットでは、ComicFestaアニメやニコニコ動画ほかで配信された。本作のアニメには「完全版」と「通常版」があり、原作に近い大人向けの表現を用いた完全版は、ComicFestaアニメ限定で配信されている。また、完全版と通常版ではキャストが異なり、完全版は相澤みのりを桜乃ひよ、羽田野秋彦をあさぎ夕が、通常版はみのりを五十嵐裕美、羽田野を八代拓が、それぞれ演じている。