概要
人間が機械に管理、培養され、マトリックスと言われる仮想世界の夢を見させられている、「マトリックス」の未来世界。世界のそこかしこで、現実世界と仮想世界のひずみ、バグに気づき、目覚めて機械との戦いに身を投じる者たちが現れはじめる。
登場人物・キャラクター
キッド
『アニマトリックス』「キッズ・ストーリー」の主役。映画「マトリックス」にも登場する少年。現実的な夢や、学校生活などの日常から、マトリックス世界の違和感に気づき、彼のいる世界が仮想世界である事を知る。
アレクサ
機械に支配された現実世界で、マシンを生け捕りにして解析・改造、寝返らせて、マシン同士で戦わせる集団のメンバーの一人。マシンを人間側に寝返らせるためにマシンの意識へダイブするが、あるマシンの意識にダイブした際にトラブルに巻き込まれる。
デュオ
『アニマトリックス』「プログラム」 に登場するザイオンの男戦士。黒い武者の格好で、シズを迎えに来る。
陽子 (ようこ)
仮想世界の内の日本、東京を模したエリアに住む。いなくなった飼い猫のユキを探す中で、近隣の子どもたちが「お化け屋敷」と呼ぶ廃墟のような古びた建物で、超常現象が続出する非日常的な風景に遭遇する。
シズ
『アニマトリックス』「プログラム」 に登場するザイオンの女戦士。戦国時代のような設定のトレーニングプログラムの中のため、白い女武者の姿をしている。
ジュエ
マトリックスに対抗する組織の船、「オシリス号」のクルー。彼らの住む土地、ザイオンに迫る危機を住人に知らせるために、マトリックスのシステムを介して、情報を伝えようとする賭けに出る。
ダン
8秒99の100メートル競走世界記録の保持者。限界を越えた運動能力によって、マトリックスのバグ、ひずみを認識する。しかしその事によってダンはエージェントに監視されることになる。
アッシュ
謎のハッカートリニティを捜す依頼を受ける。捜査を進めていくが、自分と同じ依頼を受けた探偵たちが皆何らかの異常をきたしていたという事実を知る。そして、ついにトリニティとの接触を果たすアッシュが依頼の本当の意味を知った時、エージェントの魔手が彼を襲う。