英雄機関

21世紀の終わり、人類は気候変動や資源枯渇という危機を乗り越えるために宇宙へ進出したものの、間もなく未知の巨大生命体「星獣」という新たな脅威に直面する。人類は星獣に対抗する唯一の手段として、人型機動兵器「機鎧(アイギス)」を開発した。そのパイロットたちは、かつて星獣に蹂躙（じゅうりん）されるしかなかった宇宙開拓者たちにとって、まさに希望の光だった。人々は彼らを「英雄」や「守護神」と称え、その活躍に熱狂している。しかし、その栄光の裏側で、「英雄」たちが謎の組織「英雄機関」のプロパガンダに利用されているという事実は、まだほとんど知られていない。一方で、世間では機鎧の戦闘を模したVRシューティングゲーム「アイギス」が大流行しており、英雄へのあこがれは人々の日常に深く根付いている。

機鎧の製造メーカーで技術者を務めるリュウは、わずか10歳でVRシューティングゲーム「アイギス」の世界王者となった息子、レオニダスを何よりも誇りに思っていた。父子の絆は非常に強かったが、天才の息子を持つ凡庸な父親として、リュウは周囲から「トンビが鷹を産んだ」と心ない陰口をたたかれ、人知れず苦悩していた。そんな折、リュウは「英雄機関」から機鎧パイロットとしてスカウトを受ける。愛する息子のそばを離れたくないと一度は断るものの、「息子が真に誇れる父親でありたい」という思いから、彼はあえて危険な道を選ぶ決意をする。しかし、リュウが目の当たりにしたのは、「英雄」たちが駒として使い捨てられる英雄機関の冷酷な実態だった。すべてを悟ったリュウは、息子のもとへ帰るため除隊を決意する。だがその矢先、親交のあったミレニア親子が乗る輸送船が星獣に襲われる。リュウは二人を救うため、量産型の機鎧で出撃し、死闘の末に星獣を撃退する。しかし、信頼していたはずの上官、ゲオルギー・シンの裏切りに遭い、その凶弾を受けて命を落とす。リュウの死の真相は英雄機関による情報操作で隠蔽され、彼の死は「星獣と相打ちになった悲劇の英雄」として世に語り継がれることとなった。

リュウは星獣との戦いで命を落とし、その死を深く悲しむレオニダスの前に、リュウを殺した張本人であるゲオルギーが現れる。ゲオルギーは機鎧の操縦を教えると申し出て、レオニダスは彼の正体を知らぬまま厳しい訓練を受け、優れたパイロットへと成長していく。それから4年後、幸福省の職員、ユーリ・ムラトフがレオニダスの前に現れた。ユーリもまた、かつて兄を英雄として失い、その死が「英雄機関」に利用された過去を持ち、組織に強い疑念を抱いていた。彼はリュウの死も英雄機関による陰謀である可能性が高いことを突き止め、レオニダスに協力を申し出る。ユーリの提案を受け入れたレオニダスは、彼の助言に従い、英雄機関の内部を探るため直属の教育機関である「イーストポイント宇宙軍士官学校」へ入学するのだった。