探偵明智は狂乱す

ごくふつうの女子中学生、マユミは、探偵にあこがれて小学生の頃から身近な事件を解決してきた。一方、明智はかつて名探偵として名を馳せた男性だが、現在は死後3年を経た幽霊となっている。明智はマユミに憑依しなければ自由に移動することができず、一方のマユミは彼の強引な捜査に巻き込まれながらも、好奇心を抑えきれない。そんな二人の不思議なバディ関係こそが、本作の大きな魅力の一つとなっている。

明智は、かつてパノラマ島の地下王国で多くの怪人を殺害し、自爆という壮絶な最期を遂げたと伝えられている。その証拠として、島には今も巨大な爆発跡と無数の人骨が風化することなく残されている。明智がなぜ怪人たちを無差別に殺戮（さつりく）したのか、その真相はマユミにも明かされていないが、その行為によって怪人二十面相の娘であり、「二代目怪人二十面相」を名乗るグリモアから、明智は深い恨みを買っている。明智の死の真相や、かつてマユミを救出した際の紳士的な姿から、現在の粗暴な姿へと変貌してしまった理由が、作品全体を通しての大きな謎となっている。

かつてパノラマ島の地下王国で多くの怪人たちと共に生活をしていたグリモアの証言によれば、怪人二十面相とその妻は明智によって殺害されている。しかし、明智とマユミが怪人蜘蛛男を捕まえた際、蜘蛛男は「怪人二十面相は生きている」という衝撃的な情報を明かす。その真偽を確かめるためにパノラマ島を訪れた明智とマユミは、そこでかつて怪人たちの慰み者となり、命を奪われた明智の妻、文代の変わり果てた姿を目撃する。その光景を目の当たりにした明智は、冷静さを失い、激しく動揺する。