U19

2036年、日本の住民は政府によってランク付けされ、様々な制限を受ける生活を余儀なくされていた。そんな中、子供たちは徹底した管理教育を受け、自由な言動は封じられ、大人たちに理不尽に支配されていた。茨城県日立市の遠山高校に通う1年生・紅童衛児は、裁縫が趣味の草食系男子。しかし、現在の体制に様々な疑問を抱き、思ったことをすぐ口にするため、教師たちからは目をつけられている。

隣人で幼馴染の月野朱梨は、そんな彼をいつもかばっていた。ある日、突然、学校で行われた新政策「遺伝子検査」で、朱梨は「SSS」の結果を出してしまう。あらゆる病気・ウイルスに対して超高度の免疫力を持つことが判明した朱梨は、東京のAランク高校である陽の出学園への転校が決まる。

別れを前に衛児は、朱梨に「恋人になろう」と思いを告白し、朱梨もこれを受け入れる。しかし、日本を支配する大人党は、ふたりを引き裂き、朱梨を無理やり転校させてしまう。朱梨を奪われ呆然とする衛児。だが、その怒りが頂点に達したとき、彼には不思議な力が芽生える。指先から赤い糸と針が出現するようになり、これを自由自在に操ることができるようになったのだ。

これはリビドーと呼ばれる能力で、強いストレスにさらされた人間に発動するものであった。リビドーに目覚めた衛児は、政府打倒を目指す子供たちの組織ガレージキッドに誘われ、仲間となる。こうして、「赤い糸」と呼ばれるリビドーを使いこなすようになった衛児は、朱梨を取り戻すための戦いを開始する。