アラクニド

蜘蛛が所属する「組織」は現代日本の闇に潜み、人を殺害し、その存在すら消し去ってしまう「殺し屋集団」。その組織は謎に包まれており、一般人には名前すら知られておらず、ただ単に「組織」と呼ばれ、裏社会では恐れられていた。本作に登場する殺し屋たちはそれぞれ虫由来の特殊能力や武器を持ち、それらを駆使して派手なバトルアクションを行うのが特徴となっている。珍しい種類の虫はもちろん、ありふれた虫にも隠された能力があることが解説されている。

藤井有栖は生まれつき過剰ともいえる集中力を持つことから、一つの物事に集中するとほかの物事に注意を払うことができず、日常生活にも支障をきたしていた。母親は1年前に自殺し、素行不良な叔父に引き取られて虐待される日々を送っていた。学校でも孤独で、クラスメイトからはいじめを受けており、どこにも居場所がなかった。しかしある日、叔父が「蜘蛛」を名乗る殺し屋に殺される現場を目撃し、有栖も蜘蛛に殺されそうになるが、死の間際に驚異的な集中力を発揮して反撃する。この行動に蜘蛛は有栖の殺し屋としての才能を見抜き、彼女を連れ去って殺し屋の術を叩（たた）き込むのだった。

藤井有栖は蜘蛛に保護され、殺し屋としての道を歩む日々を送っていたが、次第に蜘蛛に愛着を抱くようになり、遂には彼を父親のように慕うようになる。しかし、そんな日々も突然、蜘蛛の手によって幕が引かれる。突如、蜘蛛に襲われた有栖は反撃して蜘蛛を殺害してしまう。実は蜘蛛は自分の人生を嫌悪して死にたがっていたことを知った有栖は、彼の遺言に従って強く生きることを誓う。そして、有栖は組織に新たな「蜘蛛」として勧誘されるが、有栖は自分の名前を大切にするためこの申し出を拒絶。すると、組織から次々と刺客を送り込まれるようになり、否応なしに望まぬ戦いに身を投じていくこととなる。